Kontrola zarządcza to ogół działań podejmowanych we wszystkich rodzajach aktywności, które konieczne są dla zapewnienia realizacji pożądanych celów i zadań Muzeum im. ks. dr. Władysława Łęgi w Grudziądzu w sposób zgodny z prawem, efektywny, oszczędny i terminowy. 

Najistotniejszym elementem kontroli zarządczej w Muzeum jest system wyznaczania celów i system monitorowania ich realizacji. 

Kontrola zarządcza w Muzeum im. ks. dr. Władysława Łęgi w Grudziądzu wykonywana jest z uwzględnieniem zasad korzystania z dóbr kultury, badań naukowych i nauczania, a także samodzielności gospodarowania przydzieloną i nabytą częścią mienia i posiadanymi środkami.